1.本發(fā)明公開涉及結(jié)合至血管內(nèi)皮生長因子(vegf)和血管生成素(例如,血管生成素1和血管生成素2)兩者的融合分子(例如,多肽)、基于這些融合分子的基因療法及其使用方法。
背景技術(shù):
0、2.背景技術(shù)
1、vegf/vegfr和血管生成素/tie-2信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路在血管內(nèi)皮生長(血管生成)過程中以及在血管生成相關(guān)血管的維持中是重要的。參見biela?and?siemann,cancerlett.380(2):525-533(2016)。異常血管生成涉及一些病況,如糖尿病性視網(wǎng)膜病、銀屑病,滲出性或“濕性”年齡相關(guān)性黃斑變性(“wamd”)、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎及其它炎性疾病和大部分癌癥。與這些病況相關(guān)的患病組織或腫瘤通常表達(dá)異常高水平的vegf并且顯示出高度的血管形成或血管通透性。例如,wamd是血管生成疾病,其特征為老年個(gè)體中的一只眼或兩只眼中的脈絡(luò)膜新生血管并且是致盲的主要原因。參見gehrs等人,ann?med.38(7):450-471(2006)。存在用于抑制異常血管生成,靶向vegf或血管生成素的一些治療策略。參見bielaand?siemann,cancer?lett.380(2):525-533(2016)。然而,這些治療通常需要反復(fù)注射,其可以在一些患者中提高炎癥、感染和其它不利影響的風(fēng)險(xiǎn)。反復(fù)注射還與患者的順從性相關(guān),并且堅(jiān)持困難和不順從性可以導(dǎo)致視力喪失和眼部疾病或病況的惡化。對于需要關(guān)于施用反復(fù)或頻繁拜訪醫(yī)療辦公室的治療方案的不順從性和不堅(jiān)持的比例在大部分受amd影響的老年患者中特別高。在本領(lǐng)域中,需要改善的治療性分子,具體地在用于治療疾病,如wamd的基因療法中使用的治療性分子。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
0、3.發(fā)明概述
1、在一個(gè)方面,本文提供了多肽,其包含:(i)結(jié)合至vegf的第一結(jié)構(gòu)域;(ii)結(jié)合至vegf的第二結(jié)構(gòu)域;和(iii)結(jié)合至血管生成素(例如,血管生成素1和血管生成素2)的第三結(jié)構(gòu)域。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域任選地處于第一結(jié)構(gòu)域和第二結(jié)構(gòu)域的n-末端。
2、在一些實(shí)施方式中,第一結(jié)構(gòu)域來源于vegf受體-1(vegfr-1或flt-1)。在一些實(shí)施方式中,第一結(jié)構(gòu)域包含vegfr-1的結(jié)構(gòu)域2或其變體。在一些實(shí)施方式中,第一結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:1所示的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成。在一些實(shí)施方式中,第一結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:1具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成。
3、在一些實(shí)施方式中,第二結(jié)構(gòu)域來源于vegf受體-2(vegfr-2或flk-1)。在一些實(shí)施方式中,第二結(jié)構(gòu)域包含vegfr-2的結(jié)構(gòu)域3或其變體。在一些實(shí)施方式中,第二結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:2所示的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成。在一些實(shí)施方式中,第二結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:2具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成。
4、在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域(abd)包含seq?id?no:3所示的氨基酸序列的一個(gè)或兩個(gè)重復(fù)。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:51所示的氨基酸序列的一個(gè)或兩個(gè)重復(fù)。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:3所示的氨基酸序列的兩個(gè)重復(fù)。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:51所示的氨基酸序列的兩個(gè)重復(fù)。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:3所示的氨基酸序列和seq?id?no:51所示的氨基酸序列。
5、在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:4所示的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成,或者第三結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:4具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列。
6、在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:52所示的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成,或者第三結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:52具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列。
7、在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:53所示的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成,或者第三結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:53具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列。
8、在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域包含seq?id?no:54所示的氨基酸序列或者由所述氨基酸序列組成,或者第三結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:54具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列。
9、在另一個(gè)方面,本文提供了多肽,其包含(i)結(jié)合至vegf的第一結(jié)構(gòu)域,所述第一結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:1具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列;(ii)結(jié)合至vegf的第二結(jié)構(gòu)域,所述第二結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:2具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列;和(iii)結(jié)合至血管生成素的第三結(jié)構(gòu)域,所述第三結(jié)構(gòu)域包含兩條氨基酸序列,每條序列包含與seq?id?no:3具有至少80%、85%、90%或100%同一性的氨基酸序列。
10、在另一個(gè)方面,本文提供了多肽,其包含(i)結(jié)合至vegf的第一結(jié)構(gòu)域,所述第一結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:1具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列;(ii)結(jié)合至vegf的第二結(jié)構(gòu)域,所述第二結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:2具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列;和(iii)結(jié)合至血管生成素的第三結(jié)構(gòu)域,所述第三結(jié)構(gòu)域包含兩條氨基酸序列,每條序列包含與seq?id?no:51具有至少80%、85%、90%或100%同一性的氨基酸序列。
11、在另一個(gè)方面,本文提供了多肽,其包含(i)結(jié)合至vegf的第一結(jié)構(gòu)域,所述第一結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:1具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列;(ii)結(jié)合至vegf的第二結(jié)構(gòu)域,所述第二結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:2具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列;和(iii)結(jié)合至血管生成素的第三結(jié)構(gòu)域,所述第三結(jié)構(gòu)域包含一條與seq?id?no:3具有至少80%、85%、90%或100%同一性的氨基酸序列,和一條與seq?id?no:51具有至少80%、85%、90%或100%同一性的氨基酸序列。
12、在一些實(shí)施方式中,所述多肽還包含抗體的fc區(qū)。在一些實(shí)施方式中,所述fc區(qū)包含seq?id?no:5所示的氨基酸序列。
13、在一些實(shí)施方式中,所述多肽還包含信號肽。在一些實(shí)施方式中,所述信號肽包含seq?id?no:6所示的氨基酸序列。
14、在一些實(shí)施方式中,所述多肽還包含一個(gè)或多個(gè)接頭。
15、在一些實(shí)施方式中,本文提供了多肽,其包含seq?id?no:7、seq?id?no:8、seq?idno:9或seq?id?no:10所示的氨基酸序列,或者與seq?id?no:7、seq?id?no:8、seq?id?no:9或seq?id?no:10具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列。
16、在一些實(shí)施方式中,本文提供了多肽,其包含seq?id?no:58、seq?id?no:59、seqid?no:60、seq?id?no:61、seq?id?no:62、seq?id?no:63、seq?id?no:64、seq?id?no:65或seq?id?no:66所示的氨基酸序列,或者與seq?id?no:58、seq?id?no:59、seq?id?no:60、seqid?no:61、seq?id?no:62、seq?id?no:63、seq?id?no:64、seq?id?no:65或seq?id?no:66具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一性的氨基酸序列。
17、在一些實(shí)施方式中,本文所提供的多肽還包含vegfc結(jié)合結(jié)構(gòu)域。在一些實(shí)施方式中,所述vegfc結(jié)合結(jié)構(gòu)域來源于vegfr-2。在其它實(shí)施方式中,所述vegfc結(jié)合結(jié)構(gòu)域來源于vegfr-3。
18、在一些實(shí)施方式中,所述vegfc結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:55具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列。
19、在一些實(shí)施方式中,所述vegfc結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:56具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列。
20、在一些實(shí)施方式中,所述vegfc結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含與seq?id?no:57具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列。
21、在一些實(shí)施方式中,所述多肽基因融合或化學(xué)綴合至試劑。
22、在另一個(gè)方面,本文提供了分離的核酸,其包含編碼本文所提供的多肽的核酸序列。
23、在另一個(gè)方面,本文提供了載體,其包含本文所提供的分離的核酸。在一些實(shí)施方式中,所述載體是病毒載體。在一些實(shí)施方式中,所述病毒載體是腺病毒相關(guān)病毒(aav)載體。在一些實(shí)施方式中,所述aav載體來源于aav1、aav2、aav2i8、aav3、aav3-b、aav4、aav5、aav6、aav7、aav8、aavrh8、aavrh8r、aav9、aav10、aavrh10、aav11、aav12、aav13、aav-dj、aavlk03、aavrh74、aav44-9或其組合或變體。在一些實(shí)施方式中,所述載體是重組aav2(raav2)載體、重組aav8(raav8)載體或其變體。
24、在另一個(gè)方面,本文提供了重組aav(raav)載體,其包含編碼多肽的核酸,其中所述多肽包含(i)來源于vegfr-1的第一結(jié)構(gòu)域;(ii)來源于vegfr-2的第二結(jié)構(gòu)域;和(iii)能夠結(jié)合至血管生成素(例如,血管生成素1和血管生成素2)的第三結(jié)構(gòu)域,其中所述raav載體包含來自下列的末端反向重復(fù)(itr):aav1、aav2、aav2i8、aav3、aav3-b、aav4、aav5、aav6、aav7、aav8、aavrh8、aavrh8r、aav9、aav10、aavrh10、aav11、aav12、aav13、aav-dj、aavlk03、aavrh74、aav44-9或其組合或變體。在一些實(shí)施方式中,所述itr來自aav2。在其它實(shí)施方式中,所述itr來自aav8。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域處于第一結(jié)構(gòu)域和第二結(jié)構(gòu)域的n-末端。
25、在另一個(gè)方面,本文提供了重組aav(raav)載體,其包含編碼多肽的核酸,其中所述多肽包含(i)來源于vegfr-1的第一結(jié)構(gòu)域;(ii)來源于vegfr-2的第二結(jié)構(gòu)域;和(iii)能夠結(jié)合至血管生成素的第三結(jié)構(gòu)域;和(iv)能夠結(jié)合至vegfc的第四結(jié)構(gòu)域,其中所述raav載體包含來自下列的末端反向重復(fù)(itr):aav1、aav2、aav2i8、aav3、aav3-b、aav4、aav5、aav6、aav7、aav8、aavrh8、aavrh8r、aav9、aav10、aavrh10、aav11、aav12、aav13、aav-dj、aav?lk03、aavrh74或aav44-9。在一些實(shí)施方式中,所述itr來自aav2。在其它實(shí)施方式中,所述itr來自aav8。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域處于第一結(jié)構(gòu)域和第二結(jié)構(gòu)域的n-末端。
26、在一些實(shí)施方式中,本文提供了載體,所述載體包含seq?id?no:11、seq?id?no:12、seq?id?no:13、seq?id?no:14、seq?id?no:15、seq?id?no:16、seq?id?no:17、seq?idno:18、seq?id?no:19、seq?id?no:20、seq?id?no:21、seq?id?no:22或seq?id?no:23所示的核酸序列,或者與seq?id?no:11、seq?id?no:12、seq?id?no:13、seq?id?no:14、seq?id?no:15、seq?id?no:16、seq?id?no:17、seq?id?no:18、seq?id?no:19、seq?id?no:20、seq?idno:21、seq?id?no:22或seq?id?no:23具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%的同一性的核酸序列。
27、在一些實(shí)施方式中,本文提供了載體,所述載體包含seq?id?no:67、seq?id?no:68、seq?id?no:69、seq?id?no:70、seq?id?no:71、seq?id?no:72、seq?id?no:73、seq?idno:74或seq?id?no:75所示的核酸序列,或者與seq?id?no:67、seq?id?no:68、seq?id?no:69、seq?id?no:70、seq?id?no:71、seq?id?no:72、seq?id?no:73、seq?id?no:74或seq?idno:75具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%的同一性的核酸序列。
28、在另一個(gè)方面,本文提供了重組aav(raav)顆粒,其包含(a)編碼多肽的核酸,其中所述多肽包含(i)來源于vegfr-1的第一結(jié)構(gòu)域;(ii)來源于vegfr-2的第二結(jié)構(gòu)域;和(iii)能夠結(jié)合至血管生成素(例如,血管生成素1和血管生成素2)的第三結(jié)構(gòu)域;和(b)下列的衣殼蛋白:aav1、aav2、aav2i8、aav3、aav3-b、aav4、aav5、aav6、aav7、aav8、aavrh8、aavrh8r、aav9、aav10、aavrh10、aav11、aav12、aav13、aav-dj、aav?lk03、aavrh74、aav44-9或其變體。在一些實(shí)施方式中,第三結(jié)構(gòu)域處于第一結(jié)構(gòu)域和第二結(jié)構(gòu)域的n-末端。在一些實(shí)施方式中,所述衣殼蛋白是aav2衣殼蛋白。在一些實(shí)施方式中,所述衣殼蛋白是aav8衣殼蛋白。在一些實(shí)施方式中,所述衣殼蛋白是包含seq?id?no:48所示的氨基酸序列的aav2衣殼蛋白的變體,其中所述變體包含aav2的衣殼蛋白vpl的氨基酸替換y444f、r487g、t491v、y500f、r585s、r588t和y730f。
29、在另一個(gè)方面,本文提供了重組aav(raav)顆粒,其包含(a)編碼多肽的核酸,其中所述多肽包含(i)來源于vegfr-1的第一結(jié)構(gòu)域;(ii)來源于vegfr-2的第二結(jié)構(gòu)域;和(iii)能夠結(jié)合至血管生成素的第三結(jié)構(gòu)域;和(iv)能夠結(jié)合至vegfc的第四結(jié)構(gòu)域;和(b)下列的衣殼蛋白:aav1、aav2、aav2i8、aav3、aav3-b、aav4、aav5、aav6、aav7、aav8、aavrh8、aavrh8r、aav9、aav10、aavrh10、aav11、aav12、aav13、aav-dj、aav?lk03、aavrh74、aav44-9或其變體。
30、藥物組合物,其包含本文所提供的多肽、載體或raav載體或者raav顆粒和藥學(xué)上可接受的賦形劑。
31、在另一個(gè)方面,本文提供了治療受試者中疾病或病癥的方法,其包括向所述受試者施用本文所提供的多肽、載體或藥物組合物。在一些實(shí)施方式中,所述疾病或病癥是血管生成或新生血管疾病或病癥。在一些實(shí)施方式中,所述疾病或病癥是炎性疾病、眼部疾病、自體免疫疾病或癌癥。在一些實(shí)施方式中,所述疾病或病癥是眼部疾病或病癥。在一些實(shí)施方式中,所述眼部疾病或病癥選自葡萄膜炎、色素性視網(wǎng)膜炎、新生血管型青光眼、糖尿病性視網(wǎng)膜病(dr)(包括增殖性糖尿病性視網(wǎng)膜病)、缺血性視網(wǎng)膜病、眼內(nèi)新血管形成、年齡相關(guān)性黃斑變性(amd)、視網(wǎng)膜新血管形成、糖尿病性黃斑水腫(dme)、糖尿病性視網(wǎng)膜缺血、糖尿病性視網(wǎng)膜水腫、視網(wǎng)膜靜脈阻塞(包括視網(wǎng)膜中央靜脈阻塞和視網(wǎng)膜分支靜脈阻塞)、黃斑水腫和視網(wǎng)膜靜脈阻塞(rvo)后黃斑水腫。在一些實(shí)施方式中,所述疾病或病癥是年齡相關(guān)性黃斑變性(amd)。在一些實(shí)施方式中,所述amd是濕性amd(wamd)。
32、在一些實(shí)施方式中,所述方法包括通過向受試者眼部玻璃體內(nèi)或視網(wǎng)膜下注射的施用。